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arraystar AS-NM-001-1說明書

更新時間:2018-08-07      點(diǎn)擊次數(shù):2064

 

Arraystar致力于幫助生物醫(yī)學(xué)科學(xué)研究人員了解監(jiān)管非編碼RNA(ncRNAs),這已成為21世紀(jì)生物醫(yī)學(xué)研究中吸引力和挑戰(zhàn)性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA,環(huán)狀RNA,微小RNA,tRNA,tRF,tiRNA,snoRNA等。自2009年成立以來,我們在ncRNA研究領(lǐng)域的創(chuàng)新產(chǎn)品,深入的實(shí)驗(yàn)專業(yè)知識和強(qiáng)大的生物信息學(xué)支持了數(shù)百種高影響力的出版物。多年來,我們的客戶群已擴(kuò)展到數(shù)千個研究機(jī)構(gòu)。 

超越RNA

隨著新型非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)及其超出蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本的調(diào)控活性,RNA生物學(xué)領(lǐng)域的研究意味著超越編碼信使RNA,這是中心法則的重點(diǎn)。揭示新型ncRNA的關(guān)鍵作用的追求引起了強(qiáng)烈的科學(xué)興趣,具有發(fā)現(xiàn)新的疾病調(diào)節(jié)劑,新的生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)的誘人機(jī)會。雖然基因表達(dá)分析行業(yè)仍主要僅涵蓋mRNA,但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進(jìn)。 

焦點(diǎn)

除了傳統(tǒng)的mRNA表達(dá)分析之外,Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉(zhuǎn)錄組范圍分析,每個類具有不同的RNA特性和生物活性,需要更專業(yè)的方法和生物信息學(xué)來分析:

•lncRNAs 
•環(huán)狀RNAs 
•tRNAs 
•tRFs和tiRNAs 
•snoRNAs 
•microRNAs及其靶mRNA 
•piRNAs 

 

NuRNA™tRNA修飾酶PCR陣列(H)

Arraystar NuRNA™人類tRNA修飾酶PCR Array描述了參與tRNA修飾的85種關(guān)鍵酶和蛋白質(zhì)因子的基因表達(dá)。Array是一種快速,方便和強(qiáng)大的工具,可用于探索和分析這些tRNA修飾因子,以便在形成,微調(diào)和調(diào)節(jié)tRNA功能(如蛋白質(zhì)翻譯,代謝,應(yīng)激反應(yīng)和疾?。┲邪l(fā)揮作用。

 

Product Name

Catalog No

Size

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

AS-NM-001-1

384 (4x96)-well plate

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NM-001-1-R

384 (4x96)-well plate

 

 

優(yōu)點(diǎn)
•*內(nèi)容 - 涵蓋UniProt和Modomics中的所有tRNA修飾酶
•嚴(yán)格 - 所有引物對和分析都經(jīng)過精心優(yōu)化和嚴(yán)格驗(yàn)證 
•方便 - 易于使用的平板格式,可直接用于完整分析樣品。不需要樣品預(yù)擴(kuò)增。

我們建議在運(yùn)行NuRNA™tRNA修飾酶PCR陣列時使用我們的rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒  (AS-FS-001)ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix,以獲得*性能。

 

tRNA是蛋白質(zhì)翻譯中用于解碼帶電荷氨基酸的遺傳密碼的關(guān)鍵組分。近的研究表明,tRNA以及它們衍生的小的非編碼RNApian段是動態(tài)調(diào)節(jié)的,具有非常規(guī)功能,如適應(yīng)性翻譯,細(xì)胞增殖/分化,應(yīng)激反應(yīng),代謝和疾病[1]。

tRNA在轉(zhuǎn)錄后經(jīng)過大量修飾,具有多種化學(xué)修飾。這些修改對于整形,微調(diào)和調(diào)節(jié)tRNA功能的所有方面(如折疊,穩(wěn)定性和解碼)至關(guān)重要。例如,莖環(huán)中的修飾對于tRNA結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定性是至關(guān)重要的,在反密碼子環(huán)中用于翻譯準(zhǔn)確性,在第34位用于密碼子 - 反密碼子擺動,并且在反密碼子環(huán)附近用于微調(diào)密碼子 - 反密碼子相互作用(圖1)。 )。 

 

圖1.人類tRNA修飾和tRNA修飾酶(括號中)。

這些化學(xué)修飾由tRNA修飾酶動態(tài)調(diào)節(jié)和催化[2]。tRNA修飾物的突變或失調(diào)與疾病有關(guān),例如,具有小頭畸形的胞嘧啶-5 RNA甲基轉(zhuǎn)移酶(NSUN2)突變[3]和具有2型糖尿病的t6A甲基硫醇化酶[4]。疾病中tRNA修飾的新興重要性需要額外的工作[5,6]。如何通過tRNA修飾酶調(diào)節(jié)tRNA修飾是有必要進(jìn)行研究的。

為了幫助研究人員快速方便地分析參與tRNA修飾的酶,Arraystar已經(jīng)生產(chǎn)出個專門用于分析tRNA修飾酶的商業(yè)PCR板。該小組包含85種經(jīng)過驗(yàn)證或預(yù)測的tRNA修飾酶或蛋白質(zhì)因子,這些酶來自研究出版物和數(shù)據(jù)庫,包括UniProt和Modomics。面板上的每個測定都在許多組織和細(xì)胞系中得到嚴(yán)格驗(yàn)證。包括加標(biāo)對照,陽性PCR對照,基因組DNA控制和標(biāo)準(zhǔn)化參考,以確保高的數(shù)據(jù)質(zhì)量。

參考

[1] Kirchner S,Ignatova Z. tRNA在適應(yīng)性翻譯,信號動態(tài)和疾病中的新興作用。自然評論Genetics 2015; 16:98-112。
[2] El Yacoubi B,Bailly M,de Crecy-Lagard V.生物合成和轉(zhuǎn)錄RNA轉(zhuǎn)錄后修飾的功能。遺傳學(xué)年度回顧2012; 46:69-95。
[3] Blanco S,Dietmann S,F(xiàn)lores JV,Hussain S,Kutter C,Humphreys P,et al。tRNA的異常甲基化將細(xì)胞應(yīng)激與神經(jīng)發(fā)育障礙聯(lián)系起來。EMBO期刊2014; 33:2020-39。
[4] Zhou B,Wei FY,Kanai N,F(xiàn)ujimura A,Kaitsuka T,Tomizawa K.通過人類編碼獨(dú)立機(jī)制調(diào)節(jié)2型糖尿病風(fēng)險因子CDKAL1水平的剪接變體的鑒定。Human molecular genetics 2014; 23:4639-50。
[5] Zhang X,Cozen AE,Liu Y,Chen Q,Lowe TM。小RNA修飾:功能和疾病的整合。2016年分子醫(yī)學(xué)趨勢。
[6] Suzuki T,Nagao A,Suzuki T.人類線粒體tRNA:生物發(fā)生,功能,結(jié)構(gòu)方面和疾病。遺傳學(xué)年度回顧2011; 45:299-329。

 

 

工作流程

 

 

兼容的qPCR儀器:

ABI ViiA™7 
ABI 7500和ABI 7500 FAST 
ABI 7900HT 
ABI QuantStudio™6 Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
ABI QuantStudio™7 Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
ABI QuantStudio™12K Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
Bio-Rad CFX384 
Bio-Rad iCycler &iQ實(shí)時PCR系統(tǒng)
Eppendorf Realplex 
QIAGEN轉(zhuǎn)子基因Q 100 
Roche Light Cycler 480 
Stratagene Mx3000 
Roche Light Cycler 480

 

 

 

 

 

Arraystar 2018年產(chǎn)品列表

 

貨號

品名

規(guī)格

品牌

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-004-1

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004-1-R

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004M-1

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-004M-1-R

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-001-1

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-001-1-R

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-002-1

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-002-1-R

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-003-1

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-003-1-R

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-004-1

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

384-well plate

arraystar

AS-NM-004-1-R

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well plate

arraystar

AS-NR-001H-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001H-1-R

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1-R

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-MB-001

Seq-Star™ rRNA Removal Kit

Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation

arraystar

AS-MB-006-01

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-006-02

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-007

Seq-Star™ DNAClean Beads

50mL

arraystar

AS-MB-008-01

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-008-02

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-010-01

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-010-02

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-012-01

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-012-02

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-013-01

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA)

24 reactions

arraystar

AS-MB-013-02

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB)

24 reactions

arraystar

AS-PACK-001-A

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-PACK-001-B

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-MR-005-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-005-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL

25mL

arraystar

AS-MR-006-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-006-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL

25mL

arraystar

AS-FS-001

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-002

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-003

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

6 reactions

arraystar

AS-FS-003-02

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-004

rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-002-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001M-1-M

rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-004-1-M

rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-002-1

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well(2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002-1-R

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1

nrStar™ Mouse tRF PCR Array

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1-R

nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-003-1

nrStar™ Human snoRNA PCR Array

384 well / plate

arraystar

AS-NR-003-1-R

nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 well / plate

arraystar

 

 

 

 

上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司是實(shí)驗(yàn)試劑一站式采購服務(wù)商

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